Основные группы прокариот

В сокращенном виде представлены два варианта классификации прокариот в соответствии с последними изданиями руководства Берджи по идентификации [Определитель бактерий Берджи. В 2 т. / Пер. С англ. Под ред. Дж. Хоулта Н. Крига, П. Снита, Дж. Стейли и С. Уильямса., 9–е изд., М., 1997.] (1) и систематике [Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 2–nd Ed. Vol. 1. Ed. D. R. Boone, R. W. Castenholz. Springer–Verlag, N. Y., Berlin, Heidelberg, 2001.] (2) бактерий.1 Грамотрицательные бактерииГРУППА 1. Спирохеты (Borrelia, Spirochaeta, Treponema[В скобках указаны названия нескольких характерных родов.])ГРУППА 2. Аэробные/микроаэрофильные, подвижные, спиральные/ изогнутые грамотрицательные бактерии (Aquaspirillum, Bdello–vibrio, Helicobacter)ГРУППА 3.

Неподвижные (или редко – подвижные) грамотрицательные изогнутые бактерии (Ancylobacter, Spirosoma)ГРУППА 4. Грамотрицательные, аэробные/микроаэрофильные палочки и коккиПОДГРУППА 1 (Agrobacterium, Azotobacter, Bradyrhizobium, Methy–lobacterium, Paracoccus, Rhizobium, Zoogloea)ПОДГРУППА 2 (Taylorella, Wolinella)ГРУППА 5. Факультативно анаэробные грамотрицательные палочкиПОДГРУППА 1. Семейство Enterobacteriaceae (Klebsiella, Proteus, Salmonella)ПОДГРУППА 2. Семейство Vibrionaceae (Aeromonas, Vibrio)ПОДГРУППА 3. Семейство Pasteurellaceae (Pasteurella)ПОДГРУППА 4. Другие родыГРУППА 6. Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые и спиральные бактерии (Acetogenium, Bacteroides, Fusobacterium, Selenomonas)ГРУППА 7.

Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серыПОДГРУППА 1 (Desulfotomaculum)ПОДГРУППА 2 (Desulfomicrobium, Desulfovibrio)ПОДГРУППА 3 (Desulfobacter, Desulfococcus, Desulfonema)ПОДГРУППА 4 (Desulfurella, Desulfuromonas)ГРУППА 8. Анаэробные грамотрицательные кокки (Syntrophococcus, Yeillonella)ГРУППА 9. Риккетсии и хламидии (Rickettsia, Chlamydia)ГРУППА 10. Аноксигенные фототрофные бактерииПОДГРУППА 1 (Chromatium, Thiocapsa, Thiospirillum)ПОДГРУППА 2 (Ectothiorhodospira)ПОДГРУППА 3 (Rhodobacter, Rhodopseudomonas, Rhodospirillum)ПОДГРУППА 4 (Heliobacillus, Heliobacterium)ПОДГРУППА 5 (Chlorobium, Prosthecochloris)ПОДГРУППА 6 (Chloroflexus)ПОДГРУППА 7 (Erythrobacter)ГРУППА 11.

Оксигенные фототрофные бактерииI. ЦианобактерииПОДГРУППА 1 (Порядок Chroococcales. Synechococcus)ПОДГРУППА 2 (Порядок Pleurocapsales. Dermocarpa)ПОДГРУППА 3 (Порядок Oscillatoriales. Oscillatoria, Spirulina)ПОДГРУППА 4 (Порядок Nostocales. Anabaena, Nostoc, Calothrix)ПОДГРУППА 5 (Порядок Stigonematales. Fischerella, Stigonema)II. Прохлорофиты (Порядок Prochlorales. Prochloron, Prochlorothrix)ГРУППА 12. Аэробные хемолитотрофные бактерии и родственные им организмыПОДГРУППА 1. Бесцветные сероокисляющие бактерии (Thiobacillus)ПОДГРУППА 2. Железо–и марганецокисляющие и/или осаждающие бактерии (Gallionella, Metallogenium, Siderocapsa)ПОДГРУППА 3. Нитрифицирующие бактерии (Nitrobacter, Nitro–coccus, Nitrosomonas, Nitrosospira)ГРУППА 13.

Почкующиеся и/или обладающие выростами бактерииПОДГРУППА 1. Простекобактерии (Caulobacter, Hyphomicrobium)ПОДГРУППА 2. Порядок Planctomycetales (Planctomyces)ПОДГРУППА 3. Другие почкующиеся и/или обладающие выростами бактерии (Nevskia, Seliberia)ГРУППА 14. Бактерии, обладающие чехлом (Leptothrix, Sphaerotilus)ГРУППА 15. Нефотосинтезирующие, не образующие плодовых тел скользящие бактерииПОДГРУППА 1. Одноклеточные палочковидные скользящие бактерии (Cytophaga, Flexibacter)ПОДГРУППА 2. Плоские нитчатые скользящие бактерии (Alysiella, Simonsiella)ПОДГРУППА 3. Сероокисляющие скользящие бактерии (Achromatium, Beggiatoa)ПОДГРУППА 4. Пелонемы («Pelonema», «Peloploca»)ГРУППА 16. Скользящие бактерии, образующие плодовые тела.

Мик–собактерии (Chondromyces, Myxococcus, Polyangium)Грамположительные бактерииГРУППА 17. Грамположительные кокки (Leuconostoc, Micrococcus, Staphylococcus)ГРУППА 18. Грамположительные палочки и кокки, образующие эндоспоры (Bacillus, Clostridium, Sulfobacillus)ГРУППА 19. Грамположительные неспорообразующие палочки правильной формы (Caryophanon, Lactobacillus)ГРУППА 20. Грамположительные неспорообразующие палочки неправильной формы (Arthrobacter, Bifidobacterium, Propionibacterium)ГРУППА 21. Микобактерии (Mycobacterium)ГРУППЫ 22–29. АктиномицетыГРУППА 22. Нокардиоформные актиномицетыПОДГРУППА 1. Бактерии, содержащие миколовые кислоты (No–cardia, Rhodococcus)ПОДГРУППА 2. Pseudonocardia и близкие родыПОДГРУППА 3. Nocardioides и TerrabacterПОДГРУППА 4.

Promicromonospora и близкие родыГРУППА 23. Роды с многогнездными спорангиями (Frankia)ГРУППА 24. Актинопланы (Actinoplanes)ГРУППА 25. Стрептомицеты и близкие роды (Streptomyces)ГРУППА 26. МадуромицетыПОДГРУППА 1. Streptosporangium и родственные таксоныПОДГРУППА 2. ActinomaduraГРУППА 27. Thermomonospora и близкие родыГРУППА 28. Термоактиномицеты (Thermoactinomyces)ГРУППА 29. Другие родыМикоплазмыГРУППА 30. Микоплазмы (или молликуты). Бактерии без клеточной стенки (Mycoplasma)Архебактерии (археи)ГРУППА 31. МетаногеныПОДГРУППА 1 (Methanobacterium)ПОДГРУППА 2 (Methanococcus)ПОДГРУППА 3 (Methanosarcina)ГРУППА 32. Сульфатредуцирующие археи (Archaeoglobus)ГРУППА 33. Экстремально галофильные аэробные архебактерии (галобактерии) (Halobacterium, Halococcus, Natronococcus)ГРУППА 34.

Архебактерии, лишенные клеточной стенки (Thermoplasma)ГРУППА 35. Экстремальные термофилы и гипертермофилы, метаболизирующие SПОДГРУППА 1 (Acidianus, Sulfolobus)ПОДГРУППА 2 (Pyrobaculum, Thermoproteus)ПОДГРУППА 3 (Desulfurococcus, Pyrodictium, Thermococcus)2 Домен ArchaeaФИЛА [Фила (филум, филогенетическая линия) в определенной степени соответствует отделу.] А1 CrenarchaeotaКЛАСС 1 Thermoprotei (Thermoproteus, Sulfolobus, Acidianus)ФИЛА А2 EuryarchaeotaКЛАСС 1 Methanobacteria (Methanobacterium)КЛАСС 2 Methanococci (Methanococcus, Methanosarcina)КЛАСС 3 Halobacteria (Halobacterium, Natronobacterium)КЛАСС 4 Thermoplasmata (Thermoplasma)КЛАСС 5 Thermococci (Thermococcus)КЛАСС 6 Archaeoglobi (Archaeoglobus)КЛАСС 7 Methanopyri (Methanopyrus)Домен BacteriaФИЛА B1 AquificaeКЛАСС 1 Aquificae (Aquifex)ФИЛА В2 ThermotogaeКЛАСС 1 Thermotogae (Thermotoga)ФИЛА В3 ThermodesulfobacteriaКЛАСС 1 Thermodesulfobacteria (Thermodesulfobacterium)ФИЛА В4 «Deinococcus–Thermus» [В кавычках приводятся таксономические названия, не получившие до настоящего времени официального статуса в соответствии с Международным кодексом номенклатуры бактерий.]КЛАСС 1 Deinococci (Deinococcus, Thermus)ФИЛА В5 ChrysiogenetesКЛАСС 1 Chrysiogenetes (Chrysiogenes)ФИЛА В6 ChloroflexiКЛАСС 1 «Chloroflexi» (Chloroflexus)ФИЛА В7 ThermomicrobiaКЛАСС 1 Thermomicrobia (Thermomicrobium)ФИЛА В8 NitrospiraeКЛАСС 1 «Nitrospira» (Nitrospira, Leptospirillum)ФИЛА В9 DeferribacteresКЛАСС 1 Deferribacteres (Deferribacter)ФИЛА В10 CyanobacteriaКЛАСС 1 «Cyanobacteria» (Microcystis, Prochloron, Pleurocapsa, Oscillatoria, Nostoc, Stigonema)ФИЛА В11 ChlorobiКЛАСС 1 «Chlorobia» (Chlorobium)ФИЛА В12 ProteobacteriaКЛАСС 1 «Alphaproteobacteria» (Rhodospirillum, Azospirillum, Rickettsia, Paracoccus, Sphingomonas, Caulobacter, Rhizobium, Nitrobacter, Rhodopseudomonas, Hyphomicrobium)КЛАСС 2 «Betaproteobacteria» (Alcaligenes, Thiobacillus, Nitrosomo–nas, Zoogloea)КЛАСС 3 «Gammaproteobacteria» (Chromatium, Ectothiorhodospira, Beggiatoa, Legionella, Pseudomonas, Azotobacter, Vibrio, Escherichia, Proteus, Salmonella)КЛАСС 4 «Deltaproteobacteria» (Desulfurella, Desulfovibrio, Bdello–vibrio, Myxococcus)КЛАСС 5 «Epsilonproteobacteria» (Helicobacter, Wolinella)ФИЛА В13 FirmicutesКЛАСС 1 «Clostridia» (Clostridium, Desulfotomaculum)КЛАСС 2 Mollicutes (Mycoplasma)КЛАСС 3 «Bacilli» (Bacillus, Lactobacillus)ФИЛА В14 ActinobacteriaКЛАСС 1 Actinobacteriaceae (Micrococcus, Arthrobacter, Mycobacterium, Nocardia, Streptomyces, Frankia, Bifidobacterium)ФИЛА В15 PlanctomycetesКЛАСС 1 «Planctomycetacia» (Planctomyces)ФИЛА В14 ChlamydiaeКЛАСС 1 «Chlamydiae» (Chlamydia)ФИЛА В17 SpirochaetesКЛАСС 1 «Spirochaetes» (Spirochaeta)ФИЛА В18 FibrobacteresКЛАСС 1 «Fibrobacteres» (Fibrobacter)ФИЛА В19 AcidobacteriaКЛАСС 1 «Acidobacteria» (Acidobacterium)ФИЛА В20 BacteroidetesКЛАСС 1 «Bacteroides» (Bacteroides)КЛАСС 2 «Flavobacteria» (Flavobacterium)КЛАСС 3 Sphingobacteria (Sphingobacterium, Flexibacter, Cytophaga)ФИЛА В21 FusobacteriaКЛАСС 1 «Fusobacteria» (Fusobacterium)ФИЛА В22 VerrucomicrobiaКЛАСС 1 Verrucomicrobiae (Verrucomicrobium)ФИЛА В23 DictyoglomiКЛАСС 1 «Dictyoglomi» (Dictyoglomus)(Источник.

«Микробиология. Словарь терминов», Фирсов Н.Н., М. Дрофа, 2006 г.).